95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1514 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
210 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  59.52 
 
 
179 aa  194  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  57.23 
 
 
168 aa  191  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  58.28 
 
 
164 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  55.36 
 
 
167 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  55.09 
 
 
182 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  53.99 
 
 
167 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  54.27 
 
 
168 aa  171  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  53.99 
 
 
172 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  53.37 
 
 
172 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  53.37 
 
 
172 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  51.93 
 
 
177 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  53.8 
 
 
178 aa  159  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  43.66 
 
 
181 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  41.77 
 
 
160 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.31 
 
 
164 aa  98.2  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  35.26 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  35.26 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.4 
 
 
162 aa  88.6  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.12 
 
 
165 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  28.93 
 
 
164 aa  86.3  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.37 
 
 
160 aa  86.3  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.14 
 
 
164 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  31.97 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  31.85 
 
 
163 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  30.38 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  30.38 
 
 
163 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  33.74 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.97 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  32.12 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  31.85 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  32.35 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  28.4 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.1 
 
 
172 aa  67.8  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.23 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.42 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.97 
 
 
167 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.58 
 
 
161 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  27.78 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  35.56 
 
 
158 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.53 
 
 
162 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  36.62 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  28.03 
 
 
164 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  29.34 
 
 
157 aa  56.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  33.53 
 
 
173 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  24.56 
 
 
156 aa  55.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
170 aa  54.7  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  31.03 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  34.38 
 
 
160 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  32.37 
 
 
148 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  33.09 
 
 
162 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.92 
 
 
157 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  28.08 
 
 
180 aa  52.8  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.08 
 
 
172 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  26.85 
 
 
171 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  27.4 
 
 
171 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.76 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  28.57 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  30.38 
 
 
160 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  27.21 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.72 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.9 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.79 
 
 
167 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  34.97 
 
 
151 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.09 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  27.37 
 
 
162 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  31.06 
 
 
157 aa  48.5  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  25.57 
 
 
166 aa  48.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  35.33 
 
 
190 aa  48.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.12 
 
 
171 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  35.9 
 
 
174 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  30.67 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.25 
 
 
167 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  25 
 
 
155 aa  45.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  25.77 
 
 
173 aa  45.1  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.09 
 
 
180 aa  45.1  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  32.7 
 
 
161 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  31.88 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01710  retrograde transport, endosome to Golgi-related protein, putative  28.57 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  31.65 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.15 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  32.59 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  26.9 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  29.32 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01341  vacuolar protein sorting 29, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09480)  29.79 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0461116  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0879  diadenosine tetraphosphatase-like protein  24.79 
 
 
284 aa  43.5  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.237996  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  29.3 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  26.92 
 
 
166 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  26.34 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  33.33 
 
 
168 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.47 
 
 
170 aa  42  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  29.03 
 
 
176 aa  41.6  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  32.81 
 
 
154 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>