187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1354 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 		 159 aa  330  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.95 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  40.88 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  36.02 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  37.41 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  38.69 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.36 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.36 
 
 		 154 aa  94  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.19 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.9 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  36.05 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.7 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  31.45 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  31.65 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  35.67 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  36.18 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.12 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.16 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  29.75 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  29.75 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  29.75 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  29.75 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.55 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  29.11 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  29.11 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  29.11 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  29.11 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  29.11 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  36.11 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  36.11 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.86 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  29.11 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  34.93 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  28.81 
 
 		 187 aa  73.9  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  30.3 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  28.4 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  37.8 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.43 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  31.71 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  30.18 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  30.25 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  29.93 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.65 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  30.68 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  28.98 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  28.16 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.89 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  29.14 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  32.43 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  30.18 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  28.48 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  32.67 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  29.82 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  31.76 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  28.24 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  26.63 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  27.33 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  29.09 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  31.61 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  28.4 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  27.33 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  33.99 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  33.04 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  31.25 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  26.04 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  28.31 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  27.61 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.33 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  28.05 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.45 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  28.39 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  29.03 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  28.09 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  26.7 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  27.81 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  26.45 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  28.82 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  32.34 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  27.08 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.38 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.47 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.88 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.98 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  32.45 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  27.98 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  27.01 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  26.11 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  28.77 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>