90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1257 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.94 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  38.52 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  37.59 
 
 
162 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  33.33 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  33.08 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.3 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.09 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.82 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  35.56 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  34.59 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.09 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.85 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.59 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  29.1 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  29.32 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.77 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.43 
 
 
159 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.01 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  34.75 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  29.32 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  28.57 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.24 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  29.1 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  28.57 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  28.57 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  25.75 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  28.57 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  30.88 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  29.63 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  30.46 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  34.07 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  36.46 
 
 
167 aa  62.8  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.37 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  29.32 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.86 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  28.47 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  25.71 
 
 
173 aa  53.9  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  29.41 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  29.5 
 
 
177 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  25.14 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  26.22 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.16 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  30.37 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  30.37 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.14 
 
 
182 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  28.67 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  25.66 
 
 
157 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.29 
 
 
180 aa  47  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  27.34 
 
 
166 aa  47  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  30.08 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  24.18 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  24.34 
 
 
188 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  23.72 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.02 
 
 
196 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.74 
 
 
163 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.55 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  29.32 
 
 
152 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  25.9 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.81 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  23.16 
 
 
183 aa  42.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  25.42 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  26.89 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.18 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  26.89 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.32 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  21.57 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  21.57 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  21.57 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  21.57 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  21.57 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  24.64 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  25 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  20.51 
 
 
188 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  23.16 
 
 
183 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.42 
 
 
164 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  31.01 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  24.34 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  22.67 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.3 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  23.3 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  23.3 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  23.3 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  23.3 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  23.3 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  22.67 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  23.3 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  30.93 
 
 
196 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  25.32 
 
 
184 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>