138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2676 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  85.16 
 
 		 183 aa  323  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  85.16 
 
 		 183 aa  323  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  85.16 
 
 		 183 aa  323  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  85.16 
 
 		 183 aa  323  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  85.16 
 
 		 183 aa  323  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  82.97 
 
 		 183 aa  317  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  72.53 
 
 		 183 aa  271  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  71.43 
 
 		 183 aa  269  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  70.33 
 
 		 183 aa  268  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  69.23 
 
 		 183 aa  262  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  69.23 
 
 		 183 aa  261  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  68.68 
 
 		 183 aa  260  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  68.68 
 
 		 183 aa  260  6.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  68.68 
 
 		 183 aa  260  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  58.01 
 
 		 185 aa  228  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  59.88 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  54.64 
 
 		 187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  53.85 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  57.39 
 
 		 189 aa  201  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  51.1 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  55.37 
 
 		 193 aa  194  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  47.28 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  42.86 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  44.26 
 
 		 188 aa  164  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  47.19 
 
 		 182 aa  154  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  48.78 
 
 		 174 aa  151  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.37 
 
 		 182 aa  151  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  48.15 
 
 		 178 aa  147  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.97 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  40 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  40.48 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  39.77 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  34.78 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  38.69 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.03 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  36.6 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  39.49 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.51 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  32.6 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.47 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  32.45 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  29.17 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  30.36 
 
 		 157 aa  62  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.25 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.2 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  34.11 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.14 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.14 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.63 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0618  phosphoesterase protein  31.82 
 
 		 256 aa  57.8  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  26.18 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.97 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.58 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.5 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.21 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.32 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.59 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.99 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.38 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  25.45 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.98 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.18 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  30.86 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.34 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  26.9 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1085  metallophosphoesterase  24.88 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.307111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  29.44 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  26.63 
 
 		 233 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  29.59 
 
 		 156 aa  50.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.36 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  31.31 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0273  metallophosphoesterase  28.08 
 
 		 281 aa  50.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.57 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  26.17 
 
 		 259 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  27.86 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  31.53 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  36.61 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.67 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  27.81 
 
 		 161 aa  48.5  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  30.77 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  27.65 
 
 		 297 aa  48.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  24.02 
 
 		 254 aa  47.8  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0382  metallophosphoesterase  27.65 
 
 		 259 aa  47.8  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.26 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.66 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  24 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  23.5 
 
 		 681 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  25.36 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  24.61 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  23.74 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>