111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0963 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  380  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  75.14 
 
 		 187 aa  278  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  62.71 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  61.58 
 
 		 181 aa  230  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  59.66 
 
 		 183 aa  227  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  61.45 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  62.29 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  61.93 
 
 		 185 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  58.52 
 
 		 184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  59.88 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  59.88 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  59.88 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  59.88 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  59.88 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  59.88 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  59.88 
 
 		 183 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  58.52 
 
 		 184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  57.95 
 
 		 183 aa  217  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  57.95 
 
 		 183 aa  217  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  57.95 
 
 		 183 aa  217  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  60.45 
 
 		 189 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  56.25 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  56.25 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  56.25 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  56.25 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  56.25 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  57.14 
 
 		 183 aa  210  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  57.14 
 
 		 183 aa  208  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  57.14 
 
 		 183 aa  204  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  55.49 
 
 		 183 aa  201  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  48.07 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  41.99 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.38 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  45.2 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  44.89 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  47.02 
 
 		 174 aa  157  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.33 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  46.29 
 
 		 178 aa  151  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  41.67 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  36.63 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  34.59 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  32.07 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.15 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  34.66 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  32.04 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.73 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  36.6 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  30.98 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.41 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  30.9 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  25.93 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.86 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.77 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.84 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.86 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  32.2 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.82 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  32.76 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.07 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.17 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  28.25 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.65 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  23 
 
 		 233 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  24.23 
 
 		 254 aa  51.2  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  23.71 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.87 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.67 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.31 
 
 		 243 aa  48.5  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.87 
 
 		 232 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  21.58 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  28.66 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.67 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  35.59 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.93 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  29.13 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  31.3 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  28.21 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  35.29 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4785  metallophosphoesterase  23.81 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  31.11 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  23.76 
 
 		 259 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  34.68 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  23.76 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.48 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  32.04 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.49 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0618  phosphoesterase protein  27.78 
 
 		 256 aa  45.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  21.12 
 
 		 271 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  24.07 
 
 		 297 aa  44.7  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  28.08 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.44 
 
 		 181 aa  44.3  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0272  metallophosphoesterase  29.87 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.664692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.5 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  29.06 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  34.04 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.29 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00810  Calcineurin-like phosphoesterase  35.8 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.62 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.62 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>