152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2783 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  92.35 
 
 		 183 aa  353  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  78.14 
 
 		 183 aa  297  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  75.96 
 
 		 183 aa  290  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  72.68 
 
 		 183 aa  278  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  73.63 
 
 		 183 aa  273  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  71.43 
 
 		 183 aa  269  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  71.43 
 
 		 183 aa  269  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  71.43 
 
 		 183 aa  269  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  71.43 
 
 		 183 aa  269  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  71.43 
 
 		 183 aa  269  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  71.43 
 
 		 183 aa  269  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  71.43 
 
 		 183 aa  269  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  71.43 
 
 		 184 aa  269  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  71.43 
 
 		 184 aa  269  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  67.76 
 
 		 183 aa  263  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  67.76 
 
 		 183 aa  263  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  67.76 
 
 		 183 aa  263  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  69.23 
 
 		 183 aa  260  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  69.23 
 
 		 183 aa  260  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  69.23 
 
 		 183 aa  260  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  69.23 
 
 		 183 aa  260  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  69.23 
 
 		 183 aa  260  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  60.11 
 
 		 185 aa  230  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  61.85 
 
 		 189 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  57.14 
 
 		 183 aa  208  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  58.43 
 
 		 187 aa  207  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  55.49 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  56.04 
 
 		 181 aa  204  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  57.47 
 
 		 193 aa  195  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  54.8 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  49.18 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  51.14 
 
 		 182 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  43.6 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.55 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  46.37 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  45.51 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.11 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  44.57 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  40.26 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  40.48 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  34.22 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  37.43 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  33.52 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.37 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  37.2 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.51 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  34.22 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  34.41 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.92 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.64 
 
 		 232 aa  67  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.64 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.13 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  35.59 
 
 		 168 aa  62  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.99 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.65 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.36 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  30.36 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.16 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  24.62 
 
 		 259 aa  57.8  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  26.6 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  29.61 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.18 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.71 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  24.75 
 
 		 254 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  26.63 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  24.75 
 
 		 254 aa  51.2  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.02 
 
 		 219 aa  51.2  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  24.5 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  34 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.78 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  27.78 
 
 		 271 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  25 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0413  metallophosphoesterase  27.88 
 
 		 246 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  27.05 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  25.29 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  24 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  29.09 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  27.97 
 
 		 173 aa  47.8  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  31.21 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  25.29 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1106  metallophosphoesterase  27.45 
 
 		 282 aa  47.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000252416 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.72 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2813  metallophosphoesterase  29.02 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  27.06 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  28.36 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.87 
 
 		 222 aa  47  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  27.33 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  24.71 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  27.06 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0233  hypothetical protein  27.91 
 
 		 264 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  24.87 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  26.92 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  34.38 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  27.54 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0619  metallophosphoesterase  25.93 
 
 		 265 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  37.29 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  26.47 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  27.57 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>