82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06370 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  100 
 
 
174 aa  359  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  68.36 
 
 
178 aa  260  8.999999999999999e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  66.48 
 
 
182 aa  229  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  55.8 
 
 
186 aa  203  8e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  55.29 
 
 
186 aa  198  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  51.43 
 
 
187 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  49.1 
 
 
183 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  49.1 
 
 
183 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  49.1 
 
 
183 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  49.1 
 
 
183 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  49.1 
 
 
183 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  47.02 
 
 
183 aa  157  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  44.31 
 
 
185 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  48.78 
 
 
183 aa  151  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  48.78 
 
 
183 aa  151  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  48.78 
 
 
183 aa  151  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  48.78 
 
 
183 aa  151  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  48.78 
 
 
183 aa  151  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  48.78 
 
 
183 aa  151  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  48.78 
 
 
183 aa  151  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  43.68 
 
 
181 aa  151  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  48.78 
 
 
184 aa  151  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  48.78 
 
 
184 aa  151  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  46.47 
 
 
183 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  45.09 
 
 
183 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  46.11 
 
 
183 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  48.57 
 
 
188 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  46.71 
 
 
183 aa  148  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  47.73 
 
 
182 aa  147  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  44.91 
 
 
181 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  45.88 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  46.24 
 
 
187 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  45.51 
 
 
183 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  44.87 
 
 
193 aa  137  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  43.93 
 
 
183 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  43.93 
 
 
183 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  43.93 
 
 
183 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  43.71 
 
 
189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  45.51 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  41.14 
 
 
181 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  39.38 
 
 
187 aa  98.2  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  39.38 
 
 
187 aa  97.4  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  38.04 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  37.97 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  34.18 
 
 
184 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.18 
 
 
180 aa  90.9  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  35.98 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  37.27 
 
 
188 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.41 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.28 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.65 
 
 
158 aa  59.3  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.37 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.82 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.36 
 
 
232 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.36 
 
 
232 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  25.37 
 
 
233 aa  48.5  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.14 
 
 
150 aa  48.5  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.77 
 
 
235 aa  47  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0156  metallophosphoesterase  31.11 
 
 
251 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  26.19 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1505  putative metallo-phosphoesterase  30.56 
 
 
251 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  21.94 
 
 
225 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  25 
 
 
238 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.66 
 
 
222 aa  44.3  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.59 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1085  metallophosphoesterase  25.85 
 
 
243 aa  44.3  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.307111  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2771  metallophosphoesterase  24.49 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  27.19 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0168  metallophosphoesterase  33.01 
 
 
249 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  27.65 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  28.49 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.9 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.36 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1782  metallophosphoesterase  24.06 
 
 
235 aa  42  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.865967  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  24.41 
 
 
259 aa  41.2  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.35 
 
 
170 aa  41.2  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  32.43 
 
 
243 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1892  serine/threonine specific protein phosphatase  26.04 
 
 
381 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  27.16 
 
 
172 aa  40.8  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2186  putative serine/threonine protein phosphatase  28.12 
 
 
375 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.516208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  25 
 
 
240 aa  40.8  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  28.24 
 
 
239 aa  40.8  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>