97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2650 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  74.3 
 
 
188 aa  280  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  54.59 
 
 
188 aa  191  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  51.34 
 
 
186 aa  188  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  54.8 
 
 
182 aa  180  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  51.93 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  49.72 
 
 
181 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  52.84 
 
 
183 aa  168  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  53.45 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  49.44 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  46.41 
 
 
185 aa  164  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  51.14 
 
 
183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  49.44 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  49.44 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  49.44 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  49.44 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  49.44 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  47.19 
 
 
183 aa  160  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  48.02 
 
 
189 aa  160  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  45.2 
 
 
183 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  43.26 
 
 
187 aa  157  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  47.75 
 
 
183 aa  157  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  48.88 
 
 
183 aa  155  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  48.88 
 
 
183 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  48.88 
 
 
183 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  47.19 
 
 
183 aa  154  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  46.41 
 
 
184 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  47.19 
 
 
183 aa  154  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  47.19 
 
 
183 aa  154  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  47.19 
 
 
183 aa  154  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  47.19 
 
 
183 aa  154  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  47.19 
 
 
183 aa  154  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  47.19 
 
 
183 aa  154  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  46.41 
 
 
184 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  44.75 
 
 
187 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  47.73 
 
 
174 aa  147  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  48.88 
 
 
193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  48.04 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  40 
 
 
186 aa  125  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  40.72 
 
 
187 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  38.3 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  37.57 
 
 
181 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  40.22 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  39.52 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  36.17 
 
 
184 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.24 
 
 
186 aa  104  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  36.02 
 
 
188 aa  99  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  39.22 
 
 
196 aa  99  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.8 
 
 
180 aa  95.5  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.65 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  29.79 
 
 
239 aa  68.2  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.63 
 
 
232 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.63 
 
 
232 aa  62  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  25.9 
 
 
156 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.37 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  23.81 
 
 
271 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  31.45 
 
 
157 aa  47  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.35 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  26.35 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  31.62 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  26.29 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.98 
 
 
222 aa  45.1  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.63 
 
 
184 aa  44.7  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  26.35 
 
 
167 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  26.35 
 
 
167 aa  44.7  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  26.35 
 
 
167 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  26.35 
 
 
167 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  26.35 
 
 
167 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.3 
 
 
235 aa  44.7  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.64 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  23.56 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  33.08 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  26.35 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  26.35 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  26.92 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  31.11 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.95 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.85 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.66 
 
 
163 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.96 
 
 
223 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  24.55 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  28 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  23.67 
 
 
254 aa  42.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2420  metallophosphoesterase  35.2 
 
 
249 aa  42.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  31 
 
 
166 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.73 
 
 
223 aa  42  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.07 
 
 
160 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.75 
 
 
156 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  26.04 
 
 
162 aa  42  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1782  metallophosphoesterase  37.84 
 
 
235 aa  42  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.865967  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.83 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2771  metallophosphoesterase  24.26 
 
 
239 aa  41.6  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  23.19 
 
 
254 aa  41.6  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.75 
 
 
163 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0168  metallophosphoesterase  25.53 
 
 
249 aa  40.8  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.91 
 
 
234 aa  40.8  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.496407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>