123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2300 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  100 
 
 
188 aa  380  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  74.3 
 
 
182 aa  280  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  58.24 
 
 
188 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  51.93 
 
 
186 aa  190  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  48.09 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  48.62 
 
 
183 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  52.6 
 
 
182 aa  169  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  51.15 
 
 
183 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  49.72 
 
 
183 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  44.81 
 
 
187 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  48.63 
 
 
183 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  48.35 
 
 
181 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  49.18 
 
 
183 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  48.31 
 
 
181 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  45.11 
 
 
183 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  45.11 
 
 
183 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  45.11 
 
 
183 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  45.11 
 
 
183 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  45.11 
 
 
183 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  44.26 
 
 
184 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  44.26 
 
 
184 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.26 
 
 
183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  45.65 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  44.26 
 
 
183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  44.26 
 
 
183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  45.65 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  45.65 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  44.26 
 
 
183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  44.26 
 
 
183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  44.26 
 
 
183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  44.26 
 
 
183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  45.9 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  44.89 
 
 
183 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  46.02 
 
 
189 aa  156  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  48 
 
 
178 aa  153  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  44.44 
 
 
187 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  48.57 
 
 
174 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  45.71 
 
 
193 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.54 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  41.71 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  38.5 
 
 
184 aa  120  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.92 
 
 
186 aa  120  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  42.11 
 
 
185 aa  114  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  35.71 
 
 
184 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  37.97 
 
 
187 aa  110  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  41.1 
 
 
187 aa  108  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.26 
 
 
180 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  38.61 
 
 
188 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.16 
 
 
187 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  35.36 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.43 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  27.27 
 
 
239 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.69 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.21 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  27.39 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  26.47 
 
 
238 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.1 
 
 
235 aa  51.2  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  26.14 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  29.51 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  26.67 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.02 
 
 
222 aa  49.3  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  25.28 
 
 
171 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0168  metallophosphoesterase  25.25 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.07 
 
 
178 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  30 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  30 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  30 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  30 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  30 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  30 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3480  metallophosphoesterase  27.81 
 
 
243 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0474514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  30 
 
 
167 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  24.72 
 
 
171 aa  47.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  29 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  34.78 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  24.67 
 
 
271 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  35.96 
 
 
157 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.04 
 
 
223 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  37.78 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  28.12 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  30.93 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  30.93 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  28 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.67 
 
 
170 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  25 
 
 
259 aa  45.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  29 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  27.22 
 
 
157 aa  45.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  24.1 
 
 
168 aa  44.7  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.67 
 
 
159 aa  45.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  26.19 
 
 
162 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  27.45 
 
 
171 aa  44.7  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  32.03 
 
 
168 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3372  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.58 
 
 
234 aa  44.7  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.19 
 
 
163 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.53 
 
 
154 aa  44.7  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  22.51 
 
 
254 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.43 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.04 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>