70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0076 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 		 186 aa  389  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  54.84 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  55.8 
 
 		 174 aa  203  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  49.44 
 
 		 182 aa  171  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  50.28 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  43.33 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  45.2 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  41.18 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  44.62 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  44.97 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  44.97 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.97 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  44.97 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  44.97 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  44.97 
 
 		 184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  44.97 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  44.97 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  44.97 
 
 		 184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  40.64 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  40.64 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  40.64 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  40.64 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  40.64 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  42.62 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  41.34 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  40.64 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  40.88 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  40.11 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  39.46 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  40.11 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  39.46 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  39.46 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  42.54 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  39.78 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  40.11 
 
 		 181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  40 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  38.79 
 
 		 193 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  36.93 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  37.78 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  37.04 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.49 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  34.83 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  33.93 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  33.14 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  33.53 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  33.94 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.7 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.29 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.31 
 
 		 156 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.42 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.16 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2186  putative serine/threonine protein phosphatase  30 
 
 		 375 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.516208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.7 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1892  serine/threonine specific protein phosphatase  30 
 
 		 381 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  20.09 
 
 		 233 aa  44.7  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2172  serine/threonine phosphatase, putative  31.11 
 
 		 375 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.736006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1939  metallophosphoesterase  28.89 
 
 		 375 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.68081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4785  metallophosphoesterase  22 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2118  putative serine/threonine protein phosphatase  30 
 
 		 375 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1902  serine/threonine specific protein phosphatase  30 
 
 		 314 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00369148  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2420  metallophosphoesterase  25 
 
 		 249 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.56 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1877  metallophosphoesterase  25.38 
 
 		 293 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal  0.551763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.18 
 
 		 162 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1940  serine/threonine protein phosphatase, N-terminus  28.89 
 
 		 125 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  24.74 
 
 		 243 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  34.62 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>