157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1480 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  92.35 
 
 
183 aa  353  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  79.23 
 
 
183 aa  301  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  75.41 
 
 
183 aa  290  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  71.04 
 
 
183 aa  273  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  72.53 
 
 
184 aa  272  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  72.53 
 
 
183 aa  271  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  72.53 
 
 
184 aa  272  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  72.53 
 
 
183 aa  271  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  72.53 
 
 
183 aa  271  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  72.53 
 
 
183 aa  271  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  72.53 
 
 
183 aa  271  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  72.53 
 
 
183 aa  271  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  72.53 
 
 
183 aa  271  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  72.53 
 
 
183 aa  271  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  71.43 
 
 
183 aa  267  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  71.43 
 
 
183 aa  267  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  71.43 
 
 
183 aa  267  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  71.43 
 
 
183 aa  267  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  71.43 
 
 
183 aa  267  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  68.31 
 
 
183 aa  262  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  68.31 
 
 
183 aa  262  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  68.31 
 
 
183 aa  262  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  61.2 
 
 
185 aa  235  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  59.02 
 
 
189 aa  211  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  57.14 
 
 
183 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  56.11 
 
 
187 aa  205  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  55.49 
 
 
181 aa  200  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  54.95 
 
 
181 aa  200  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  56.32 
 
 
193 aa  191  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  54.8 
 
 
186 aa  190  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  52.84 
 
 
182 aa  168  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  48.63 
 
 
188 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  42.86 
 
 
187 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.55 
 
 
182 aa  151  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  46.11 
 
 
174 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  45.81 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.11 
 
 
186 aa  136  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  43.01 
 
 
188 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  35.14 
 
 
181 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  40.24 
 
 
187 aa  122  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  39.18 
 
 
185 aa  121  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  38.46 
 
 
187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  34.62 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.53 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  34.22 
 
 
184 aa  105  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  37.8 
 
 
196 aa  104  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.45 
 
 
186 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  39.74 
 
 
188 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.15 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.15 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.82 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  29.94 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.73 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.16 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.59 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  35.96 
 
 
168 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  29.78 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  25.5 
 
 
259 aa  58.9  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  25.79 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.71 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.81 
 
 
159 aa  55.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.1 
 
 
222 aa  54.7  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.35 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1106  metallophosphoesterase  27.45 
 
 
282 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000252416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  25.83 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  26.32 
 
 
259 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  27.32 
 
 
239 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.71 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  25.29 
 
 
168 aa  52  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.53 
 
 
219 aa  52  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  26.29 
 
 
167 aa  51.2  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  24.75 
 
 
254 aa  51.2  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2813  metallophosphoesterase  29.02 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.52 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  26.4 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  25.84 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0413  metallophosphoesterase  27.88 
 
 
246 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.87 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.33 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  24.24 
 
 
254 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  34.38 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  28.03 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  28.21 
 
 
222 aa  48.9  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  25.95 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  25 
 
 
681 aa  48.5  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  26.44 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  26.73 
 
 
233 aa  48.5  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  26.44 
 
 
167 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  25.84 
 
 
167 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  29.81 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  25.98 
 
 
238 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  25.99 
 
 
167 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
271 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1782  metallophosphoesterase  24.37 
 
 
235 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.865967  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  26.4 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  25.84 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>