110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3732 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  100 
 
 
187 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  51.43 
 
 
174 aa  192  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  47.49 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  46.67 
 
 
186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  48.88 
 
 
178 aa  178  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  45.51 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  50.28 
 
 
186 aa  170  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  43.09 
 
 
181 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  42.86 
 
 
183 aa  167  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  44.81 
 
 
188 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  42.86 
 
 
184 aa  165  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.86 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  42.86 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  42.86 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  42.86 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  42.86 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  42.86 
 
 
183 aa  165  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  42.86 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  42.86 
 
 
184 aa  165  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  43.41 
 
 
183 aa  164  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  44.32 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  44.38 
 
 
183 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  41.99 
 
 
183 aa  162  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  43.6 
 
 
183 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  42.86 
 
 
183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  41.86 
 
 
183 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  42.29 
 
 
183 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  42.29 
 
 
183 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  42.29 
 
 
183 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  42.29 
 
 
183 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  42.29 
 
 
183 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  43.26 
 
 
182 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  41.76 
 
 
183 aa  157  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  41.76 
 
 
183 aa  157  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  41.76 
 
 
183 aa  157  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  37.57 
 
 
185 aa  154  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  43.58 
 
 
187 aa  154  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  41.9 
 
 
193 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  40.88 
 
 
188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  39.13 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  39.59 
 
 
196 aa  125  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.93 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  38.22 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.39 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  37.35 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  36.41 
 
 
187 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  34.78 
 
 
187 aa  108  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  35.08 
 
 
188 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  33.9 
 
 
184 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.97 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.63 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.1 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  29.11 
 
 
259 aa  64.7  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.8 
 
 
235 aa  63.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  28.17 
 
 
254 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  28.17 
 
 
254 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  26.48 
 
 
259 aa  60.5  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.54 
 
 
222 aa  58.9  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.15 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  25.26 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2718  metallophosphoesterase  23.83 
 
 
241 aa  52  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  22.28 
 
 
167 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  51.2  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  21.24 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  22.16 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  21.18 
 
 
222 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2771  metallophosphoesterase  21.74 
 
 
239 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  32.35 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  20.73 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  23 
 
 
238 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3480  metallophosphoesterase  25.11 
 
 
243 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0474514  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.95 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.91 
 
 
158 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.47 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  21.24 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  21.76 
 
 
167 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  21.76 
 
 
167 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  21.76 
 
 
167 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  21.76 
 
 
167 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  21.76 
 
 
167 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  21.24 
 
 
167 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  24.74 
 
 
177 aa  48.5  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  21.76 
 
 
167 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  25.97 
 
 
156 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.62 
 
 
223 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.34 
 
 
219 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.43 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  28.48 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  26.52 
 
 
243 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.12 
 
 
156 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3469  metallophosphoesterase  24.45 
 
 
243 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.24 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.4 
 
 
227 aa  45.1  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2263  metallophosphoesterase  25.99 
 
 
250 aa  44.7  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.985376  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.12 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  30.61 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  32.61 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.42 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.9 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.496407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2813  metallophosphoesterase  22.22 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>