131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3064 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 		 196 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  39.87 
 
 		 152 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  40.4 
 
 		 162 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  37.8 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.4 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  38.51 
 
 		 154 aa  89.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  37.2 
 
 		 157 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  39.49 
 
 		 160 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  38.61 
 
 		 152 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  35.93 
 
 		 152 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  41.18 
 
 		 155 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.47 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  37.34 
 
 		 154 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  38 
 
 		 152 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  41.06 
 
 		 151 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  39.74 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.45 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  40.4 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  40.76 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  30.94 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  29.22 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.35 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  34.59 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  35.33 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.67 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  33.74 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.96 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.96 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  37.72 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.71 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.91 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  28.92 
 
 		 153 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  34.57 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  34.75 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.43 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  32.41 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.5 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.17 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  29.86 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.81 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  30.37 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  28.08 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  27.04 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.81 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.07 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  32.03 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  23.87 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.72 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  30.37 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.71 
 
 		 170 aa  52  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  26.24 
 
 		 171 aa  51.2  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  50 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.92 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.13 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  22.58 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.4 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.64 
 
 		 167 aa  49.7  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  25.93 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  29.79 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  30.38 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  28.31 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.63 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  27.92 
 
 		 164 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.62 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  28.72 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  23.23 
 
 		 163 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.13 
 
 		 163 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.11 
 
 		 172 aa  48.1  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.02 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.14 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  30.13 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  26.9 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  26.95 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  20.97 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03671  hypothetical protein  38.6 
 
 		 64 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.71 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.84 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.58 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  29.68 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  28.49 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  31.21 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  27.11 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.29 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.54 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  28.47 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 247 aa  45.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.074661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  27.61 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  29.2 
 
 		 183 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>