166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2238 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  100 
 
 
156 aa  316  7e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  97.44 
 
 
156 aa  307  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  43.31 
 
 
166 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  39.61 
 
 
157 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  35.67 
 
 
162 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.81 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  39.84 
 
 
160 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.36 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.48 
 
 
157 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  34.59 
 
 
168 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.04 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  34.81 
 
 
167 aa  90.5  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  34.81 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  34.81 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  34.81 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  34.81 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  34.81 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  36.48 
 
 
167 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  36.08 
 
 
156 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.7 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  36.48 
 
 
167 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.65 
 
 
156 aa  89  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  34.18 
 
 
167 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  33.59 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.57 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  35.22 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  36 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  39.23 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  34.38 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.17 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.96 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.09 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  34.87 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.57 
 
 
178 aa  73.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.9 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  29.45 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  26.7 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  28.05 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  34.56 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  31.03 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.72 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  28.03 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  31.43 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  32.89 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  32.89 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  31.87 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.85 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  28.82 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  32.1 
 
 
183 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  29.19 
 
 
186 aa  61.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
170 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  28.65 
 
 
183 aa  60.5  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  28.48 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  31.45 
 
 
188 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  28.98 
 
 
185 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  26.99 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  27.98 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  28.93 
 
 
183 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  29.63 
 
 
184 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  29.63 
 
 
184 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.63 
 
 
183 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  28.79 
 
 
173 aa  57.8  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  29.63 
 
 
183 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  29.63 
 
 
183 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  29.63 
 
 
183 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  29.63 
 
 
183 aa  57.8  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  29.63 
 
 
183 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  29.63 
 
 
183 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.71 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  31.82 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  26.79 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.92 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  29.55 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  29.55 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  29.55 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.74 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
172 aa  55.1  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.06 
 
 
186 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  34 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  29.09 
 
 
178 aa  54.3  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  29.82 
 
 
174 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.47 
 
 
182 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  27.27 
 
 
187 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  29.45 
 
 
183 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  29.45 
 
 
183 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  29.45 
 
 
183 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  29.45 
 
 
183 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  29.45 
 
 
183 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  28.16 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  27.98 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.2 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  26.04 
 
 
219 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.94 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  27.04 
 
 
183 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  29.87 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.31 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  28.65 
 
 
183 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.5 
 
 
172 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  27.27 
 
 
164 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>