186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0641 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  100 
 
 
185 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  47.8 
 
 
184 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  49.69 
 
 
181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.25 
 
 
180 aa  168  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.51 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  42.02 
 
 
188 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  43.2 
 
 
187 aa  129  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  42.86 
 
 
183 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  43.79 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  39.18 
 
 
183 aa  127  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  43.79 
 
 
184 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.77 
 
 
183 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  39.77 
 
 
183 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  39.77 
 
 
183 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  39.77 
 
 
183 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  39.77 
 
 
183 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  39.77 
 
 
183 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  39.77 
 
 
183 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  39.77 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  39.77 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  39.18 
 
 
183 aa  121  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  42.21 
 
 
181 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  40.26 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  40.61 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  40.61 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  40.61 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  38.07 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  40.12 
 
 
183 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  40.12 
 
 
183 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  40.12 
 
 
183 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  36.63 
 
 
183 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  40.12 
 
 
183 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  40.12 
 
 
183 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.82 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  33.51 
 
 
185 aa  117  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  40.38 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  38.92 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  40.22 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  35.45 
 
 
196 aa  115  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  39.74 
 
 
181 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  38.22 
 
 
187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  42.11 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  39.1 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  39.87 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.7 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  35.63 
 
 
187 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  37.97 
 
 
178 aa  103  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  38.04 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  40.13 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  30.59 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  31.74 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  33.53 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.11 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.7 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  25.99 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.59 
 
 
170 aa  61.6  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  32.39 
 
 
151 aa  61.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  29.52 
 
 
160 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.39 
 
 
157 aa  61.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.87 
 
 
222 aa  60.5  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  31.79 
 
 
181 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.81 
 
 
172 aa  58.2  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  25.67 
 
 
176 aa  57.8  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.32 
 
 
162 aa  57.8  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  28.4 
 
 
163 aa  57.8  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  28.32 
 
 
164 aa  57.8  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  29.01 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.14 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  27.27 
 
 
166 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.78 
 
 
169 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  27.85 
 
 
177 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.23 
 
 
167 aa  55.1  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.84 
 
 
172 aa  54.7  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  26.09 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  27.78 
 
 
163 aa  54.7  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.19 
 
 
154 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  29.38 
 
 
157 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.14 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.99 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  29.14 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.54 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  28.04 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  28.04 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.19 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.12 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  25.64 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.01 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.16 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  28.27 
 
 
171 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.03 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0524  phosphodiesterase  26.14 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0250808  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  22.58 
 
 
167 aa  52.4  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  25.71 
 
 
156 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.11 
 
 
223 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.51 
 
 
219 aa  52  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.03 
 
 
182 aa  52  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>