160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1184 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  100 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  51.65 
 
 
184 aa  199  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  47.65 
 
 
187 aa  165  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  45.88 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  39.59 
 
 
187 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.44 
 
 
180 aa  120  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  39.01 
 
 
184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  33.85 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  35.45 
 
 
185 aa  115  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.89 
 
 
187 aa  112  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  37.5 
 
 
181 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  35.39 
 
 
181 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  39.02 
 
 
183 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  37.58 
 
 
189 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.83 
 
 
182 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  36.09 
 
 
181 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.17 
 
 
186 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  38.41 
 
 
183 aa  104  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  37.8 
 
 
183 aa  104  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  38.89 
 
 
188 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  37.87 
 
 
186 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  35.98 
 
 
183 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  37.2 
 
 
183 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  35.98 
 
 
183 aa  101  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  32.6 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.6 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  32.6 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  32.6 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  35.85 
 
 
183 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  32.6 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  32.6 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  35.85 
 
 
183 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  35.85 
 
 
183 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  32.6 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  32.6 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  32.6 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  36 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  34.64 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  34.66 
 
 
183 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  34.66 
 
 
183 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  34.66 
 
 
183 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  34.66 
 
 
183 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  34.66 
 
 
183 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  39.22 
 
 
182 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  35.36 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  37.97 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  30.98 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  33.54 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.14 
 
 
186 aa  85.9  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  32.04 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  23.89 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  26.48 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  26.48 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  23.26 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  27.22 
 
 
162 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.33 
 
 
163 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  28.72 
 
 
243 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  23.42 
 
 
233 aa  57.8  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  26.44 
 
 
259 aa  57.4  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.86 
 
 
163 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  23.67 
 
 
259 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3469  metallophosphoesterase  27.03 
 
 
243 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3480  metallophosphoesterase  27.17 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0474514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  24.56 
 
 
167 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  24.56 
 
 
167 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.05 
 
 
148 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.09 
 
 
159 aa  55.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.44 
 
 
232 aa  54.7  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  27.78 
 
 
168 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  26.11 
 
 
151 aa  54.7  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  26.84 
 
 
166 aa  54.7  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  27.84 
 
 
161 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  23.73 
 
 
155 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  26.2 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.44 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  21.6 
 
 
240 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.97 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  24.14 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.41 
 
 
154 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  24.16 
 
 
157 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  26.2 
 
 
167 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  33.73 
 
 
219 aa  52  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  26.37 
 
 
156 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  24.46 
 
 
167 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  24.46 
 
 
167 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  24.46 
 
 
167 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  24.72 
 
 
152 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  23.6 
 
 
157 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  24.46 
 
 
167 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  25.67 
 
 
167 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  21.82 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  25 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.68 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  27.47 
 
 
168 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  28.25 
 
 
163 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  24.46 
 
 
167 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  24.46 
 
 
167 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  24.86 
 
 
154 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.89 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>