157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4206 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  100 
 
 		 152 aa  299  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  73.33 
 
 		 157 aa  224  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  73.33 
 
 		 157 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  58.94 
 
 		 151 aa  180  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  55.1 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  53.33 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  58.28 
 
 		 159 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  58 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  57.55 
 
 		 154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  56 
 
 		 160 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  52.32 
 
 		 155 aa  153  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  48.34 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  47.06 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  47.71 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  46.41 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  44.44 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  48.03 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  50.34 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  42.77 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  44 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  44 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  43.33 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  35.44 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.93 
 
 		 196 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  37.09 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.42 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.62 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.54 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.9 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.39 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  36.42 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.66 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  31.58 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  36.08 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  33.54 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  30.99 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.91 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  34.59 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  30.41 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.45 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  61.82 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.94 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  31.68 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  28.39 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  29.65 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  29.61 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  30.07 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.82 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03671  hypothetical protein  53.73 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.59 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  32.61 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.09 
 
 		 175 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  32.1 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  32.89 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  30.25 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  30.25 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  32.33 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  31.91 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.88 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  38.75 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.59 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.54 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  30.22 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.48 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  28.36 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.48 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  27.85 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.36 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.3 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  29.1 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  27.71 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.74 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  33.56 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  31.41 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.67 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.77 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  32.69 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  32.69 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  32.05 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.61 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.67 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  29.09 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.58 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  32.89 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  29.27 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.32 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.59 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  30.94 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  33.56 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.08 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  35.21 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  24.72 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.88 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>