80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3000 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 		 163 aa  342  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  57.58 
 
 		 171 aa  213  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  55.28 
 
 		 166 aa  197  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  53.37 
 
 		 173 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  54.43 
 
 		 178 aa  189  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  51.83 
 
 		 163 aa  180  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  51.22 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  50.3 
 
 		 188 aa  170  9e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  47.88 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  45.28 
 
 		 170 aa  154  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.3 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  33.75 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  32.47 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.62 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  33.58 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  32.39 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  34.93 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.19 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.19 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  31.21 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  35.19 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  32.85 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  30.92 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  32.85 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  30.13 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  26.28 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  30.25 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  29.94 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  29.63 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  26.42 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  30.43 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.71 
 
 		 196 aa  67.4  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  30.92 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  26.11 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.6 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  26.75 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  31.11 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  26.92 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  31.21 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.67 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  46.43 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  26.11 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  31.94 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  25.79 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.15 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  30.83 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  23.94 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.91 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  28.24 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  33.03 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.09 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.84 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.66 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  25.75 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  28.24 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  29.65 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.01 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.66 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  30.37 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.71 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  28.32 
 
 		 177 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.85 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  28.29 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  29.01 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  25 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  26.72 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  30.97 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  29.46 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  28.29 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  23.12 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  23.12 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0524  phosphodiesterase  27.49 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0250808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.03 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  25.81 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.4 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  26.4 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  27.95 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>