54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2971 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  100 
 
 
163 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  57.32 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  58.13 
 
 
167 aa  191  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  57.14 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  54.78 
 
 
178 aa  187  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  56.44 
 
 
173 aa  184  5e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  52.73 
 
 
171 aa  179  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  50.93 
 
 
163 aa  174  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  52.76 
 
 
166 aa  174  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  47.88 
 
 
163 aa  164  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.67 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  35.29 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  35.04 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  35.33 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.57 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.09 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.57 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.15 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  30.53 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  30.53 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  35.34 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  29.41 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  32.86 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.59 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  32.06 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  29.87 
 
 
153 aa  62.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  32.67 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  32 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  32.33 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  32.33 
 
 
152 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  30.83 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  30.83 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  29.08 
 
 
174 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  42.67 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.58 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  31.72 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.24 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  38.37 
 
 
186 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  44.44 
 
 
195 aa  51.6  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  36.78 
 
 
176 aa  51.2  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  31.91 
 
 
165 aa  50.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  31.06 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  31.79 
 
 
190 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.67 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.48 
 
 
163 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  29.58 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  31.34 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.47 
 
 
196 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.05 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  26.44 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  33.05 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  30 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  27.19 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>