94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1389 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  100 
 
 
178 aa  359  9e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  68.21 
 
 
190 aa  244  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  47.27 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  32.42 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  30.91 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  30.91 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.93 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  37.06 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.91 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  29.09 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.36 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  31.52 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  26.22 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  30.91 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  31.82 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  33.74 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  32.43 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.69 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.36 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  31.25 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  30 
 
 
154 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.72 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  28.99 
 
 
153 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.24 
 
 
163 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  29.71 
 
 
157 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  29.71 
 
 
157 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  30.77 
 
 
152 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  31.69 
 
 
162 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.38 
 
 
165 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  33.1 
 
 
154 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  32.12 
 
 
173 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.55 
 
 
167 aa  57.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  30.43 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  29.29 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.12 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  30.73 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.12 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  27.22 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.09 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  31.72 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.16 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  31.79 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  30.22 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  33.54 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.52 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  26.32 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.82 
 
 
162 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  35.71 
 
 
152 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  28.82 
 
 
182 aa  52  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.92 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  27.65 
 
 
160 aa  51.2  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.77 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  22.53 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  24.16 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1112  phosphodiesterase  28.57 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.279035  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  29.8 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.17 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  24.83 
 
 
163 aa  48.5  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  23.86 
 
 
176 aa  48.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  24.16 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  23.81 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.54 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  24.85 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.71 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.14 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  37.68 
 
 
195 aa  45.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  30.07 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  28.48 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  30.07 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.18 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.18 
 
 
156 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  26.19 
 
 
162 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
172 aa  44.3  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.72 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  32.91 
 
 
86 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.89 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  24.43 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  27.54 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  25.81 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  25.28 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  29.17 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.15 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.33 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.95 
 
 
159 aa  42  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  24.56 
 
 
171 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.97 
 
 
167 aa  42  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  29.87 
 
 
188 aa  41.6  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.75 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  23.64 
 
 
157 aa  41.6  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.46 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  25.17 
 
 
171 aa  41.2  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>