137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2610 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  100 
 
 		 152 aa  304  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  88.16 
 
 		 152 aa  275  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  66.45 
 
 		 155 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  64.47 
 
 		 152 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  52.67 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  54 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  52.9 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  50.72 
 
 		 162 aa  141  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  47.71 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  47.71 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  47.68 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  47.68 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  46.41 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  40.13 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  47.59 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  43.24 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  44.97 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.84 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.84 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  42.47 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  42.11 
 
 		 174 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  37.01 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.87 
 
 		 196 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.9 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  37.58 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.66 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  63.16 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.1 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  35.26 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  34.44 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.57 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  36.81 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  35.29 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  31.33 
 
 		 190 aa  77  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  36 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  35.42 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  29.09 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.43 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.13 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  32.64 
 
 		 179 aa  70.5  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  30.43 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.33 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.24 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  30.72 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  40 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  30.61 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  32.74 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  34.93 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  32.52 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  29.93 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.39 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  33.58 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  27.33 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  29.05 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.32 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.03 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  28.08 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.58 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  27.15 
 
 		 181 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  35.46 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.31 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.71 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  32.12 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.78 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.65 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  32.35 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.13 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  30 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  28.1 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  28.87 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.86 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  32 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  26.54 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  28.19 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  25.44 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  29.63 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  29.41 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.64 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.28 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.47 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  30.92 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  31.43 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.27 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  28.87 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.24 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  26.35 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  28.37 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.06 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  30.06 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  28.17 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.23 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.78 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  27.74 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.95 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.08 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  28.85 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>