135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2552 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  100 
 
 
156 aa  319  9.000000000000001e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  46.85 
 
 
156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  48.25 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  47.44 
 
 
157 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  45.45 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.76 
 
 
154 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  48.25 
 
 
161 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  38.64 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  34.64 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  35.71 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  33.33 
 
 
162 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.1 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.59 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  37.21 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.18 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.81 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  35.53 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.38 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.3 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  33.55 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  32.89 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  33.55 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  33.33 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  32.89 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  32.89 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  32.89 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  32.89 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.1 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  32.24 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.5 
 
 
163 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.94 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.25 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  26.57 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  26.57 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  29.63 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  32.06 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0524  phosphodiesterase  32.54 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0250808  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  30.6 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  33.57 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.58 
 
 
181 aa  60.8  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  30.38 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  33.13 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  30.41 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  31.97 
 
 
167 aa  57.4  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  27.52 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.29 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  28.99 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.33 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  30.83 
 
 
153 aa  54.3  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.86 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  29.8 
 
 
190 aa  53.9  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  27.16 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.82 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  30.64 
 
 
183 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  30.23 
 
 
183 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  25.71 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  30.06 
 
 
181 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.43 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  28.57 
 
 
178 aa  51.6  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  30.57 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.3 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  29.59 
 
 
184 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.59 
 
 
183 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  29.59 
 
 
184 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  29.59 
 
 
183 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  29.59 
 
 
183 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  29.59 
 
 
183 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  29.59 
 
 
183 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  29.59 
 
 
183 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.31 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  29.59 
 
 
183 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.84 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  28.67 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.94 
 
 
182 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  28.67 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  32.12 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.08 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  30.86 
 
 
168 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  33.77 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  30.15 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.94 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  30.77 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  31.06 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  32.1 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  31.21 
 
 
183 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  32.41 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  29.14 
 
 
181 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  24.83 
 
 
184 aa  47.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.13 
 
 
196 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  30.06 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  30.64 
 
 
183 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  31.85 
 
 
175 aa  47  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  31.43 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  31.43 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  25.89 
 
 
219 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  27.33 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  32.58 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.99 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  28.57 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>