35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0524 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0524  phosphodiesterase  100 
 
 
182 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0250808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  57.31 
 
 
181 aa  201  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  31.93 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  32.54 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.71 
 
 
154 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  27.74 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.26 
 
 
154 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  28.49 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.15 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.66 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  28.65 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  29.17 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  26.14 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  26.26 
 
 
168 aa  51.2  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  33.1 
 
 
171 aa  51.2  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  27.93 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.07 
 
 
162 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.94 
 
 
156 aa  48.5  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  31.72 
 
 
171 aa  48.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  31.65 
 
 
161 aa  47.8  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.65 
 
 
157 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  30.46 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.15 
 
 
156 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  32.24 
 
 
171 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  25.65 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  28.78 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  31.36 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.44 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  26.24 
 
 
187 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.49 
 
 
163 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.33 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.43 
 
 
172 aa  42  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  24.26 
 
 
177 aa  40.8  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>