81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0735 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  100 
 
 
169 aa  351  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  69.75 
 
 
167 aa  244  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  69.75 
 
 
167 aa  244  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.28 
 
 
169 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.65 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  40.12 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  37.65 
 
 
167 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  38.89 
 
 
167 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  38.27 
 
 
167 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  37.04 
 
 
167 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  37.04 
 
 
167 aa  104  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  37.04 
 
 
167 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  37.04 
 
 
167 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  38.89 
 
 
167 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  38.27 
 
 
167 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  35.98 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  36.57 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  30.68 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  35.66 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  34.01 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.93 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  33.78 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  35.11 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  28.14 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.53 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  31.65 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  30.9 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  29.63 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  43.21 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.56 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.24 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.82 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.58 
 
 
158 aa  62  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.09 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.48 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.61 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  30.66 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  32.82 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  27.44 
 
 
187 aa  54.7  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  32.54 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  24.38 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  27.97 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  30.65 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  27.39 
 
 
188 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.14 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  32.94 
 
 
219 aa  51.6  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  35.71 
 
 
181 aa  51.2  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.22 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  35.58 
 
 
186 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
161 aa  48.5  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  22.91 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.67 
 
 
150 aa  47.4  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  25.27 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  29.17 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  30 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.78 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.41 
 
 
186 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  27.89 
 
 
154 aa  44.3  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  29.06 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  30.09 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  31.11 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  30.09 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  30.09 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  31.31 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  25.68 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  29.9 
 
 
185 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  28.43 
 
 
183 aa  42  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.4 
 
 
196 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  28.1 
 
 
184 aa  42  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  26.52 
 
 
164 aa  41.2  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  29.05 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  28.44 
 
 
178 aa  41.2  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  29.7 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  29.7 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  29.7 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  29.7 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  29.7 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
182 aa  40.8  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  27.1 
 
 
160 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>