153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2682 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  100 
 
 		 162 aa  331  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.98 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  34.81 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  41.14 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.02 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  37.01 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.02 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.67 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  38 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.39 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  35.19 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  35.19 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  34.57 
 
 		 167 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  34.57 
 
 		 167 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  34.57 
 
 		 167 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  34.57 
 
 		 167 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  33.95 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  34.57 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.97 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  33.54 
 
 		 167 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  34.16 
 
 		 167 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  32.48 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  32.48 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.97 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.84 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  36.57 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.83 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.22 
 
 		 154 aa  87.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.48 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.59 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.01 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  28.76 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  28.76 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  32.35 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  35.71 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  31.74 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  33.13 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  29.27 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  31.61 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  32.33 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  28.89 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  35.15 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.31 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  31.1 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  29.87 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  29.49 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  28.4 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.23 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  27.22 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  29.34 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.45 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.34 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  30.12 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  32.68 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.06 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  28.24 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  32.52 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.99 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.79 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  31.21 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  27.22 
 
 		 178 aa  57  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.05 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  34.53 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.74 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  31.52 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  27.22 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.84 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  28.24 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  28.57 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  27.04 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  30.86 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  29.76 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  34.53 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.95 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  26.97 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  29.45 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  31.14 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  33.81 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  30.06 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  24.67 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  28.82 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.76 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.71 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  29.41 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  28.83 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.4 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  32.75 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.85 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  27.53 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  32.35 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.05 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.53 
 
 		 210 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  32.67 
 
 		 233 aa  48.5  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  29.63 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>