84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2380 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 		 171 aa  356  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  57.58 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  55.62 
 
 		 173 aa  208  3e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  56.71 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  53.66 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  54.55 
 
 		 188 aa  182  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  52.73 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  48.78 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  49.37 
 
 		 178 aa  171  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  48.43 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  45.06 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  38.69 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  35.66 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  34.21 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  31.85 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  34.51 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  32.91 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  37.59 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  31.06 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  33.82 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  33.82 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  28.11 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  32.37 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.57 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.57 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  34.57 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.43 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  37.33 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  32.33 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.43 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  31.97 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  32.41 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.3 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  26.88 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.87 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  31.9 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  28.85 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  31.16 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.22 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  32.35 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  28.78 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  27.78 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  30.92 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  32.31 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.88 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  30.88 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.65 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  29.85 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  27.95 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  27.74 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.58 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  47.37 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  43.64 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  28.03 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.1 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  29.55 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  25.45 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  24.5 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.12 
 
 		 210 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  26.06 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  26.99 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  22.46 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  26.19 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  28.77 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.75 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  29.63 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.63 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  30.82 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  28.47 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  26.46 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.11 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  27.97 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  29.85 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  23.7 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  29.85 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  29.85 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  30.22 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.25 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  24.03 
 
 		 171 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.24 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.5 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.37 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>