143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2125 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  100 
 
 
158 aa  322  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  37.2 
 
 
168 aa  103  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.27 
 
 
165 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  37.04 
 
 
161 aa  87  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.85 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  36.03 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  34.42 
 
 
181 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  36.03 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.06 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  34.87 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.6 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.97 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  30.38 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  33.54 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.58 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.41 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  29.71 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.33 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  27.67 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  27.67 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  27.04 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.61 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  27.82 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  29.32 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.33 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  33.8 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.32 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.97 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.82 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  31.39 
 
 
179 aa  61.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.56 
 
 
210 aa  61.2  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.38 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  28.14 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  29.41 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  27.5 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  34.53 
 
 
167 aa  58.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  29.45 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.25 
 
 
178 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.99 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.41 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  26.19 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  27.5 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  26.25 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  28.21 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  31.79 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  30.25 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  27.22 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  30.86 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  27.22 
 
 
177 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  31.17 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.58 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  30.41 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  29.87 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.06 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.87 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.12 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  28.1 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  30.41 
 
 
162 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  28.22 
 
 
190 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.37 
 
 
162 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  27.61 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  30.13 
 
 
172 aa  51.2  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  27.45 
 
 
168 aa  51.2  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  33.33 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  33.09 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  27.43 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.65 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  30.07 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  27.59 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  31.25 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.97 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  30.63 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.71 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  28 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.99 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.22 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  30.12 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  26.29 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  32.41 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  30.52 
 
 
173 aa  47.4  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  31.21 
 
 
183 aa  47.4  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  27.27 
 
 
160 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  26.8 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  29.07 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  29.07 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  29.07 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  29.07 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  29.07 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  30.3 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  26.17 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  29.93 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.06 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  26.14 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  24.32 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  25 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  25 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  28.65 
 
 
183 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>