110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0304 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  359  1e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  72.83 
 
 		 173 aa  271  5.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  43.21 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  41.38 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  39.77 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.2 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  34.13 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  35.43 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.34 
 
 		 169 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  33.75 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  33.75 
 
 		 167 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  33.12 
 
 		 167 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  33.75 
 
 		 167 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  33.12 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  33.12 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  33.12 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  33.12 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  32.5 
 
 		 167 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  33.12 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  36.97 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  36.97 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  35.66 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.05 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  28.19 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.34 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  33.09 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.5 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.72 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.01 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  32.33 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.37 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.38 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  30.83 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.12 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  32.06 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.25 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  28.93 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  33.58 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.32 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.79 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  29.17 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  24.63 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.82 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  30.26 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.72 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.79 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  29.61 
 
 		 187 aa  51.6  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  34.78 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.62 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  33.09 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  27.43 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.19 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  26.86 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 184 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.77 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  30.77 
 
 		 184 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01341  vacuolar protein sorting 29, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09480)  29.08 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0461116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  28.15 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  27.67 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.79 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  27.97 
 
 		 183 aa  47.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  28.67 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  24.19 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  28.21 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  28.89 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  28.89 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.61 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  30.14 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  25.87 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.95 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  25.87 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  26.92 
 
 		 153 aa  44.7  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  28.15 
 
 		 186 aa  44.3  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.62 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  27.81 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.17 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01710  retrograde transport, endosome to Golgi-related protein, putative  25.19 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  24.42 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  28.19 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  34.04 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.41 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.27 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  28.17 
 
 		 180 aa  42  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  29.58 
 
 		 183 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  27.61 
 
 		 155 aa  42  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  25.52 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>