25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA01710 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA01710  retrograde transport, endosome to Golgi-related protein, putative  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909765  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01341  vacuolar protein sorting 29, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09480)  59.47 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0461116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17936  predicted protein  48.89 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.572241  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80500  protein involved in endosome to golgi protein transport  39.92 
 
 		 249 aa  160  9e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205498 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  30.56 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  30 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  28.37 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  27.86 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 163 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.61 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.17 
 
 		 168 aa  51.6  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  32.14 
 
 		 179 aa  51.6  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 155 aa  48.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  27.81 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.29 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  33.64 
 
 		 160 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.66 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  31.65 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  25.19 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  25.9 
 
 		 181 aa  42  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 157 aa  41.6  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 157 aa  41.6  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  34.29 
 
 		 151 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  29.2 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>