154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2562 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  100 
 
 
183 aa  376  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  78.14 
 
 
183 aa  308  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  75.96 
 
 
183 aa  290  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  75.41 
 
 
183 aa  290  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  71.04 
 
 
183 aa  277  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  70.33 
 
 
183 aa  265  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  69.23 
 
 
184 aa  261  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  69.23 
 
 
184 aa  261  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  69.23 
 
 
183 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  69.23 
 
 
183 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  69.23 
 
 
183 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  69.23 
 
 
183 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  69.23 
 
 
183 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  69.23 
 
 
183 aa  261  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  69.23 
 
 
183 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  67.21 
 
 
183 aa  256  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  67.21 
 
 
183 aa  256  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  67.21 
 
 
183 aa  256  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  63.47 
 
 
185 aa  227  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  57.74 
 
 
181 aa  207  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  57.14 
 
 
181 aa  201  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  58.96 
 
 
189 aa  201  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  55.49 
 
 
183 aa  201  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  55.06 
 
 
187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  52.27 
 
 
193 aa  185  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  53.11 
 
 
186 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  51.15 
 
 
188 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  53.45 
 
 
182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  41.86 
 
 
187 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  45.98 
 
 
182 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  46.47 
 
 
174 aa  150  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  44.13 
 
 
178 aa  142  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  47.13 
 
 
188 aa  141  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.88 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  42.86 
 
 
185 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  35.87 
 
 
181 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  40.36 
 
 
187 aa  124  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  38.55 
 
 
187 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.89 
 
 
180 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  31.72 
 
 
184 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  38.41 
 
 
196 aa  104  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.73 
 
 
187 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.27 
 
 
186 aa  101  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  39.74 
 
 
188 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  35.33 
 
 
184 aa  100  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.51 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  28.12 
 
 
166 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  38.05 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  24.37 
 
 
259 aa  63.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  28.81 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.81 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.63 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  25 
 
 
259 aa  58.9  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.87 
 
 
232 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  25.85 
 
 
239 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  26.67 
 
 
219 aa  55.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.37 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  25.76 
 
 
254 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  30.17 
 
 
161 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  37 
 
 
170 aa  55.1  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  25 
 
 
254 aa  55.1  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.7 
 
 
235 aa  54.7  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  27.06 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.04 
 
 
156 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.04 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  27.49 
 
 
167 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  34.34 
 
 
164 aa  51.6  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.22 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  25.73 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  25.73 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  25.73 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  25.73 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
234 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.496407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  26.9 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  25.73 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  25.73 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  27.49 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  32.35 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  28.35 
 
 
222 aa  49.3  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
222 aa  48.9  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  30.3 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.59 
 
 
162 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  30.3 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0910  metallophosphoesterase  40 
 
 
247 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  29.81 
 
 
167 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  25 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  25 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  25.42 
 
 
243 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.32 
 
 
222 aa  48.5  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  26.77 
 
 
238 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  31.53 
 
 
160 aa  48.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.21 
 
 
223 aa  48.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  27.67 
 
 
171 aa  48.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1877  metallophosphoesterase  25.87 
 
 
293 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal  0.551763 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>