138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1401 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  347  5e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  46.99 
 
 
173 aa  168  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  43.21 
 
 
173 aa  142  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  36.59 
 
 
167 aa  120  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  35.98 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  35.98 
 
 
167 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  35.98 
 
 
167 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  35.98 
 
 
167 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  35.98 
 
 
167 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  35.37 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  35.37 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  35.37 
 
 
167 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  35.37 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  32.32 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.65 
 
 
169 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.51 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  33.14 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  35.76 
 
 
172 aa  107  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  38.95 
 
 
177 aa  107  9.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.23 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.25 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.19 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  35.71 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  28.14 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  34.25 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  28.92 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  28.92 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  42.11 
 
 
219 aa  70.9  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  34.35 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  35.57 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  36.44 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  32.3 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.41 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  30.82 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.61 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.93 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.11 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.46 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.11 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.77 
 
 
160 aa  60.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.33 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  34.53 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.33 
 
 
158 aa  57.4  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  31.97 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  31.48 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  32.2 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.87 
 
 
175 aa  54.7  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  28.7 
 
 
681 aa  54.7  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.14 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.69 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  28.03 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  30.15 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  34.91 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  28.1 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  27.42 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.47 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  27.42 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  27.42 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  30 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.93 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.08 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.56 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  28.66 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  31.31 
 
 
184 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.31 
 
 
183 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  31.31 
 
 
183 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  31.31 
 
 
183 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  31.31 
 
 
183 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  31.31 
 
 
183 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  31.31 
 
 
184 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  31.31 
 
 
183 aa  50.8  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  31.31 
 
 
183 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  30.43 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  27.88 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  33.33 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  30.17 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  30.61 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  30.61 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  30.61 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  30.61 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  30.61 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.68 
 
 
222 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  29.55 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  29.06 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  28.23 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  28.23 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  28.03 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  29.81 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  36.49 
 
 
189 aa  48.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  28.83 
 
 
187 aa  48.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  29.09 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  31.58 
 
 
183 aa  47.4  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  25.32 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  25 
 
 
168 aa  47.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  24.83 
 
 
168 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  33.73 
 
 
636 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  25.9 
 
 
184 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  28.85 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  30.95 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.93 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>