171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0370 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  100 
 
 
164 aa  338  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  38 
 
 
162 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.58 
 
 
158 aa  101  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  37.09 
 
 
166 aa  100  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  38.64 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.81 
 
 
157 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  38.26 
 
 
160 aa  98.6  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  39.1 
 
 
156 aa  97.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.69 
 
 
159 aa  97.1  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.69 
 
 
154 aa  95.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.01 
 
 
154 aa  94  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.93 
 
 
162 aa  94  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  36 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.33 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  38.52 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.6 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.33 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  32.89 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.29 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  33.09 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  30.41 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  36 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  36.67 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  36.67 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  35.57 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  36.67 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  36 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  36 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  36 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  36 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  36 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  33.78 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  28.82 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  34.67 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.75 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  34.57 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  30.86 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.57 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.18 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  29.8 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0524  phosphodiesterase  27.74 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0250808  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  32.09 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.5 
 
 
181 aa  61.6  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  29.94 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  32.37 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  32.37 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  33.96 
 
 
177 aa  58.2  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  28.48 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.33 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.67 
 
 
169 aa  57.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  28.32 
 
 
185 aa  57.8  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.03 
 
 
210 aa  57.4  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  26.8 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  31.94 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  29.75 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  28.85 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  29.41 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  32.08 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.97 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.69 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.03 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  30.43 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  30.43 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  28.39 
 
 
188 aa  55.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  32.87 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  32.87 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  32.82 
 
 
169 aa  55.1  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  31.29 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  31.47 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.22 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.85 
 
 
165 aa  53.9  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  30.56 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.94 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  27.51 
 
 
219 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.29 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  26.51 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  29.68 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  33.57 
 
 
176 aa  52.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.99 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.46 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.28 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  30.19 
 
 
168 aa  51.2  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.86 
 
 
169 aa  50.8  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  25.44 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  30.95 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  22.8 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.6 
 
 
222 aa  50.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  26.42 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  27.59 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  29.11 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  26.63 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.98 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  31.43 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  27.78 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  30.77 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>