130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2556 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
163 aa  326  8e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  66.05 
 
 
162 aa  219  9e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  62.42 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.96 
 
 
167 aa  103  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  37.72 
 
 
171 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  37.72 
 
 
171 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  37.13 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  98.6  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  40.14 
 
 
168 aa  97.8  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.59 
 
 
167 aa  96.3  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  38.89 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.92 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  39.35 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  37.13 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  36.97 
 
 
176 aa  91.3  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  39.05 
 
 
168 aa  89  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  38.64 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  38.64 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  32.16 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  36.43 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  37.06 
 
 
166 aa  79  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  33.58 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  34.39 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  36.36 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  32.14 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  31.45 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.92 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  31.47 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  29.34 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  36.3 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  36.3 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  32.58 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.14 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  30.82 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  24.86 
 
 
196 aa  57.8  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.95 
 
 
162 aa  57.4  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.09 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  25.14 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  32.59 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  35.71 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.45 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  33.33 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  30.66 
 
 
174 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.17 
 
 
169 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  30.52 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  28.9 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.17 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  27.1 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  26.45 
 
 
163 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  26.45 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  28.68 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  27.74 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  28.12 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  25.93 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  27.98 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.28 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.04 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  28.03 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  26.45 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.17 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.65 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  21.77 
 
 
178 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  29.85 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.04 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  24 
 
 
184 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  24 
 
 
184 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  24 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  24 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  24 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  23.53 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  24 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  24.12 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  24 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  24 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  24 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.54 
 
 
186 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.74 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  31.16 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  24.71 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  31.34 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  23.43 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  28.89 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  27.94 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.74 
 
 
175 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.74 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.22 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  29.6 
 
 
177 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
160 aa  44.3  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.25 
 
 
164 aa  44.3  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  24.85 
 
 
168 aa  43.9  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  26.06 
 
 
183 aa  43.9  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.99 
 
 
187 aa  43.9  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  25.85 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  25.17 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  25.19 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  25.93 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  25.85 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>