131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0679 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
162 aa  329  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.74 
 
 
161 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  40 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  36.6 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  34.46 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.81 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  34.27 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  32.87 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  32.17 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  34.48 
 
 
168 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  30.94 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  32.12 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.12 
 
 
169 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.29 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  27.84 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  32.5 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  26.55 
 
 
171 aa  57.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.95 
 
 
163 aa  57.4  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.75 
 
 
156 aa  57.4  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.92 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  33.93 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  33.77 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.38 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  31.55 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.7 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  33.1 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  25.99 
 
 
171 aa  54.3  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  34.53 
 
 
174 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  28.05 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  26.25 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  26.38 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  26.38 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  26.38 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  35.56 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  35.56 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  30.28 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  31.58 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  27.27 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  26.62 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  26.38 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  34.69 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  34.04 
 
 
172 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.25 
 
 
162 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  28.75 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.99 
 
 
172 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  28.03 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  28.03 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  34.04 
 
 
172 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  34.04 
 
 
172 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.22 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.84 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  27.46 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.27 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.46 
 
 
163 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  30.15 
 
 
180 aa  51.2  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.21 
 
 
179 aa  50.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  26.25 
 
 
168 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.45 
 
 
158 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.19 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  30.82 
 
 
188 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.18 
 
 
223 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  28.78 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.97 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17936  predicted protein  28.36 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.572241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  34.56 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.69 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.95 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.77 
 
 
219 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  30.28 
 
 
152 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.06 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  26.32 
 
 
181 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  29.93 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  29.93 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.74 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.04 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  33.08 
 
 
160 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  37.68 
 
 
151 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  27.54 
 
 
168 aa  47.8  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.5 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.5 
 
 
173 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  26.16 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  31.43 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  29.45 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  31.21 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.8 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  36.03 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  27.89 
 
 
222 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  29.27 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  34.06 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  27.74 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  30.18 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  27.74 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.52 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.73 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  29.31 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.4 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  28.37 
 
 
173 aa  44.7  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  30.54 
 
 
190 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  34.33 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>