186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1715 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  88.24 
 
 		 187 aa  345  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  52.17 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  45.88 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  45.74 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  43.2 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  39.52 
 
 		 183 aa  124  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  38.55 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  38.1 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  38.1 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  38.1 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  38.1 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  38.1 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  41.88 
 
 		 188 aa  121  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  38.5 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  37.43 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.86 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  38.46 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  38.69 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.69 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  38.69 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  38.69 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  38.69 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  38.69 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  38.69 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  38.69 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  38.69 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  38.76 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  37.43 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  35.11 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  34.76 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  34.41 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  39.52 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  35 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  35 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  35 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.59 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  32.07 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  36.41 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  41.1 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.65 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  31.58 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  35.54 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.52 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  39.38 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  39.38 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  29.59 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  31.91 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  38.73 
 
 		 188 aa  91.7  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.94 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  33.51 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.71 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  31.29 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.14 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.4 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  30 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  30.41 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.9 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  30.22 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.9 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  28.5 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  27.23 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  27.75 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  26.7 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  27.23 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  27.23 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  27.23 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  27.23 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  28.4 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  26.7 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.44 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  26.7 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  26.7 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  32.7 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0846  metallophosphoesterase  24.78 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.537551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2607  metallophosphoesterase  25.97 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783934 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  27.4 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.9 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.9 
 
 		 232 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  34.12 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.01 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  26.53 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.81 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  28.99 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1812  metallophosphoesterase  25.7 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.74 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  25.6 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  25.6 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  30.81 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0139  metallophosphoesterase  28.14 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.18757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  30.81 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.27 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  24.38 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  27.01 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.27 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.47 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  26.29 
 
 		 259 aa  52.4  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>