75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0611 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  100 
 
 
178 aa  365  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  40.11 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  41.48 
 
 
173 aa  132  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  36.52 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.08 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  35.43 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  33.14 
 
 
167 aa  108  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  34.3 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  38.1 
 
 
167 aa  94  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  38.1 
 
 
167 aa  94  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  37.28 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  37.5 
 
 
167 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  37.5 
 
 
167 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  37.5 
 
 
167 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  37.5 
 
 
167 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  37.5 
 
 
167 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  37.5 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.47 
 
 
163 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  37.5 
 
 
167 aa  91.7  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  30.9 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  30.11 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  30.11 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.04 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  27.22 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  29.75 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  30.77 
 
 
161 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  31.39 
 
 
160 aa  55.1  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.09 
 
 
156 aa  54.3  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.09 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  32.56 
 
 
185 aa  51.6  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  28.57 
 
 
156 aa  51.6  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  31.34 
 
 
157 aa  51.6  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.22 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.5 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  32.35 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  28.33 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.06 
 
 
157 aa  47.8  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  24.86 
 
 
184 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  31.52 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  24.86 
 
 
184 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  31.52 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  29.24 
 
 
174 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.85 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  25.74 
 
 
187 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  24.43 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  25.57 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.43 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  24.43 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  24.43 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  38.18 
 
 
187 aa  44.7  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  24.43 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  24.43 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  24.43 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.41 
 
 
182 aa  44.3  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  23.12 
 
 
183 aa  44.3  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.32 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  24.35 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  24.35 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.32 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  31.25 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  29.63 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  24.35 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  27.59 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  25.57 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  29.91 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  24.74 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  27.16 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  25.95 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  29.68 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  36.36 
 
 
187 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  28.57 
 
 
186 aa  42  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  27.14 
 
 
157 aa  41.6  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.71 
 
 
159 aa  40.8  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  29.17 
 
 
185 aa  40.8  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>