108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1741 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  100 
 
 		 157 aa  318  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  100 
 
 		 157 aa  318  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  40.79 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.74 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  34.62 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.06 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.55 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.26 
 
 		 210 aa  90.5  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.62 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.09 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  35.56 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  34.18 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  34.75 
 
 		 178 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  36.03 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  34.21 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  36.09 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  36.09 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  36.09 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.76 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  32.61 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.71 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.94 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.58 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.83 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  31.18 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.56 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.61 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.19 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  31.45 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  34.42 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  29.37 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  28.48 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  29.3 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.75 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.85 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  34.15 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  30.3 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  30.86 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  31.78 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  32.3 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.58 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  32.41 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  32.65 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  27.92 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  29.63 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  30.25 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  30.25 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  29.63 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  29.63 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  29.63 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  29.63 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  30.25 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  29.63 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.48 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  30.23 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  31.82 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  29.19 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  28.67 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.69 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  31.69 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  29.01 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.29 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.82 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.95 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.85 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.01 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.93 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  31.3 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.95 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  31.52 
 
 		 178 aa  47.4  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  27.88 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.81 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  28.68 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  28.78 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  28.4 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  27.11 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  30 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.75 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  25.77 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.63 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.75 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.35 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  28.3 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.5 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  28.99 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  22.22 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.63 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.36 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  28.24 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  24.03 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.65 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.89 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01341  vacuolar protein sorting 29, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09480)  29.85 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0461116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0792  metallophosphoesterase  38.46 
 
 		 229 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.36 
 
 		 150 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01710  retrograde transport, endosome to Golgi-related protein, putative  28.57 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>