111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1746 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  58.24 
 
 		 188 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  54.59 
 
 		 182 aa  191  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  47.28 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  44.62 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  41.08 
 
 		 183 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  41.08 
 
 		 183 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  41.08 
 
 		 183 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  41.08 
 
 		 183 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  41.08 
 
 		 183 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  47.13 
 
 		 183 aa  141  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  40.88 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  40 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  40 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  40 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  40 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  40 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  40 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  41.67 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  40 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  40 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  43.32 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  40.54 
 
 		 183 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  42.29 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  43.6 
 
 		 181 aa  134  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  43.01 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  39.46 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  44.57 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  44.94 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  42.44 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  39.89 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  39.89 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  39.89 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  45.51 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  37.36 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  39.46 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  35.6 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  39.77 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  38.89 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.04 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.43 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  32.43 
 
 		 181 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  40.13 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  38.73 
 
 		 187 aa  91.7  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.25 
 
 		 187 aa  91.7  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  32.98 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  36.69 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  32.22 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.77 
 
 		 180 aa  84.3  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  42.22 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.39 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.01 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.78 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.75 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  34.55 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  32.89 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  39.02 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  27.53 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  25.29 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  25.29 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  25.29 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  25.29 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  26.92 
 
 		 156 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  24.46 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  24.71 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  24.71 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  24.71 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  24.71 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  31.5 
 
 		 168 aa  48.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  24.46 
 
 		 171 aa  48.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  26.06 
 
 		 239 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  25.54 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  24.12 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  29.17 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  22.94 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  26.94 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  24.12 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  26.63 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.88 
 
 		 232 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.32 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.24 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.11 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.88 
 
 		 232 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  29.9 
 
 		 167 aa  44.7  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  29.9 
 
 		 167 aa  44.7  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  29.06 
 
 		 177 aa  44.7  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.77 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  26.94 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  30.81 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  26.94 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  25.4 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  23.9 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1782  metallophosphoesterase  26.78 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.865967  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  24.74 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  26.28 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.61 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  30 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.91 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  27.83 
 
 		 238 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>