168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3319 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  100 
 
 
183 aa  373  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  74.86 
 
 
183 aa  290  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  74.32 
 
 
183 aa  285  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  74.32 
 
 
183 aa  285  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  74.32 
 
 
183 aa  285  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  72.68 
 
 
183 aa  278  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  71.04 
 
 
183 aa  277  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  71.04 
 
 
183 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  70.88 
 
 
183 aa  270  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  70.88 
 
 
183 aa  270  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  70.88 
 
 
183 aa  270  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  70.88 
 
 
183 aa  270  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  70.88 
 
 
183 aa  270  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  70.33 
 
 
184 aa  269  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  70.33 
 
 
183 aa  268  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  70.33 
 
 
184 aa  269  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  70.33 
 
 
183 aa  268  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  70.33 
 
 
183 aa  268  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  70.33 
 
 
183 aa  268  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  70.33 
 
 
183 aa  268  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  70.33 
 
 
183 aa  268  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  70.33 
 
 
183 aa  268  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  69.78 
 
 
183 aa  266  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  60.66 
 
 
185 aa  236  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  62.29 
 
 
183 aa  222  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  59.89 
 
 
187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  60 
 
 
181 aa  215  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  58.82 
 
 
181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  61.27 
 
 
189 aa  207  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  53.11 
 
 
186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  54.29 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  48.62 
 
 
188 aa  170  9e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  44.38 
 
 
187 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  47.19 
 
 
182 aa  160  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  47.19 
 
 
178 aa  160  9e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.83 
 
 
182 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  45.09 
 
 
174 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.62 
 
 
186 aa  148  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  42.29 
 
 
188 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  38.83 
 
 
187 aa  117  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  33.15 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  39.1 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  35.54 
 
 
187 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.37 
 
 
180 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  35.98 
 
 
196 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.42 
 
 
187 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.97 
 
 
186 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  33.16 
 
 
184 aa  102  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  38.85 
 
 
188 aa  99  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  31.32 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.4 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.69 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  36.84 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  30.65 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.64 
 
 
232 aa  61.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  26.4 
 
 
259 aa  59.7  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.14 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.4 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.93 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0413  metallophosphoesterase  30.06 
 
 
246 aa  57.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.37 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  25.85 
 
 
238 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  26.83 
 
 
254 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.09 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  29.81 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.93 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  26.34 
 
 
254 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  28.83 
 
 
157 aa  55.1  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.38 
 
 
222 aa  54.7  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  27.94 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  27.09 
 
 
259 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.47 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  27.51 
 
 
219 aa  52.4  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  27.68 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0273  metallophosphoesterase  28.93 
 
 
281 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0168  metallophosphoesterase  23.56 
 
 
249 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  25 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.09 
 
 
222 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  26.18 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.48 
 
 
148 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  29.57 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.54 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.56 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  30.17 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  27.09 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.84 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  25.13 
 
 
239 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.59 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.82 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1363  metallophosphoesterase  24.74 
 
 
240 aa  48.5  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0352046  hitchhiker  0.00042748 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  27 
 
 
234 aa  48.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.496407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  32.17 
 
 
181 aa  48.5  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  24.02 
 
 
681 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0856  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
246 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0272546  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0618  phosphoesterase protein  29.09 
 
 
256 aa  47.8  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  27.27 
 
 
171 aa  47.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  25.6 
 
 
240 aa  47.8  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  25.93 
 
 
153 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3845  metallophosphoesterase  24.89 
 
 
271 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>