144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2256 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  100 
 
 		 153 aa  319  7e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  44.44 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  45 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  42.38 
 
 		 157 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.14 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  45.32 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  43.88 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  43.24 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.17 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  45 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  44.2 
 
 		 155 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  40.88 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  36.84 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  39.13 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  40.15 
 
 		 160 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  37.82 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  40 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  41.13 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.9 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.9 
 
 		 173 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  32.9 
 
 		 173 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  38.13 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 170 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  36.3 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  32.43 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.92 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.28 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.99 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  26.22 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  34.23 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.93 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  24.39 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.37 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  34.46 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.41 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.94 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.74 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  29.11 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.69 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.3 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.77 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.49 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  31.37 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  29.87 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.03 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  30.46 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  27.1 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.73 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  30.57 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  30 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  50.88 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  30 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  27.33 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.03 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  28.28 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  34.31 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.32 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  31.36 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  32.05 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  27.27 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  29.94 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  32.35 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  28.76 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  28.1 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  28.1 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  28.1 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  28.1 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  29.94 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  28.1 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  27.45 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  29.08 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  27.45 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  30.47 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  27.45 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  28.15 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  26.8 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  30.83 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  30.43 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  29.19 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  29.66 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.85 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  28.66 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  24.67 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  23.53 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  28.21 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  28.76 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.03 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  28.38 
 
 		 172 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.95 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  27.7 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  27.7 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.79 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.68 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  27.27 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>