175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0456 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  100 
 
 
181 aa  363  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  47.13 
 
 
160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  44.44 
 
 
161 aa  144  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.95 
 
 
165 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  46.1 
 
 
172 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  46.1 
 
 
172 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  46.1 
 
 
172 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  43.79 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.76 
 
 
168 aa  117  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.58 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.24 
 
 
179 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  42.5 
 
 
168 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  47.18 
 
 
178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.38 
 
 
167 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  43.75 
 
 
160 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.75 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.06 
 
 
164 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.52 
 
 
164 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  38.3 
 
 
164 aa  104  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  33.74 
 
 
163 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  37.14 
 
 
163 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  41.78 
 
 
177 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.66 
 
 
210 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  32.52 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  33.79 
 
 
168 aa  90.9  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  39.76 
 
 
168 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  34.71 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  34.18 
 
 
157 aa  85.1  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  34.18 
 
 
157 aa  85.1  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  34.42 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  31.82 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.24 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  34.59 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  37.34 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.69 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.93 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  34.59 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  34.71 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  37.58 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.59 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  30.63 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  33.53 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  30.82 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  32.92 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  31.74 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  34.81 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  34.84 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.73 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.09 
 
 
159 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  34.21 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  31.65 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  32.54 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.11 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.32 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.09 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  31.68 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  33.33 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.56 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.86 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.73 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  35.37 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.73 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.8 
 
 
170 aa  62  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  34.9 
 
 
154 aa  61.6  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.43 
 
 
167 aa  61.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  31.34 
 
 
166 aa  61.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  30 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  30.14 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  32.52 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.55 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.44 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.25 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.28 
 
 
172 aa  58.5  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  31.79 
 
 
185 aa  58.2  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  28.28 
 
 
153 aa  58.2  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.74 
 
 
186 aa  58.2  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  27.15 
 
 
152 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  29.85 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.85 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.93 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  27.92 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  30.22 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17936  predicted protein  38.89 
 
 
206 aa  55.1  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.572241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  26.97 
 
 
152 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  25.47 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  31.33 
 
 
160 aa  54.3  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  25 
 
 
180 aa  54.3  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1112  phosphodiesterase  31.85 
 
 
188 aa  54.3  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.279035  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.34 
 
 
159 aa  54.3  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  32.89 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.35 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  28.85 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  31.51 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.71 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  26.32 
 
 
163 aa  52.4  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  30.82 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  32.41 
 
 
173 aa  52  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  30 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  30.37 
 
 
188 aa  51.2  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  32.1 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>