124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1020 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  100 
 
 
159 aa  310  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  58.28 
 
 
152 aa  170  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  57.93 
 
 
157 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  57.93 
 
 
157 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  58.9 
 
 
150 aa  164  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  55.63 
 
 
162 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  53.1 
 
 
154 aa  157  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  55.63 
 
 
162 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  57.66 
 
 
151 aa  147  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  54.23 
 
 
160 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  56.95 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  50.34 
 
 
152 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  134  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  48.92 
 
 
155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  47.59 
 
 
152 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  49.65 
 
 
154 aa  121  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  45.77 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  49.66 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  46.62 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.62 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.62 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  39.13 
 
 
153 aa  107  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  37.84 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.74 
 
 
196 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.91 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  33.96 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.09 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  37.58 
 
 
181 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  37.09 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  32.47 
 
 
190 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  35.29 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  45.45 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.71 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  33.96 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  57.14 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  29.49 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.06 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.81 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  29.14 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  36.69 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.56 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.97 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.62 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  35 
 
 
182 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  30.87 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.92 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.61 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  30.83 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03671  hypothetical protein  47.76 
 
 
64 aa  58.9  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  26.54 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  30.43 
 
 
178 aa  57.8  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  31.01 
 
 
188 aa  57  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  35.95 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  35.95 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  30.77 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  35.29 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  25.93 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  25.93 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  26.62 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.11 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.79 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  25.93 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.97 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.97 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  28.99 
 
 
171 aa  54.3  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  32.61 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  30.22 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  28.99 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.7 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  28.99 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  25.53 
 
 
164 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  31.85 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  29.41 
 
 
179 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  24.48 
 
 
178 aa  50.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
178 aa  50.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.38 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  31.36 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  30.67 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.75 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.74 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  28 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.74 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  32.9 
 
 
182 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  31.06 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  33.81 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  30 
 
 
166 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  27.41 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  28.95 
 
 
173 aa  47.4  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  26.9 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.81 
 
 
167 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  29.49 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.78 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.86 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.4 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.85 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  29.94 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  34.69 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.31 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  27.61 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  27.61 
 
 
167 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>