132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2402 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  307  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  67.11 
 
 		 152 aa  213  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  66.45 
 
 		 152 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  64.47 
 
 		 152 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  57.55 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  57.75 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  52.32 
 
 		 152 aa  153  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  52 
 
 		 150 aa  153  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  50.33 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  49.67 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  55.63 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  52.38 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  53.33 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  46.1 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  48.92 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  45.28 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.41 
 
 		 173 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  45.1 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  45.58 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  44.2 
 
 		 153 aa  114  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  44.97 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  41.1 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.18 
 
 		 196 aa  87  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  38 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.03 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.16 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  59.65 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  36.67 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  33.97 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  31.52 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  32.87 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  32.92 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.4 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  34.25 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.52 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.69 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  37.16 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  30.95 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.43 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.03 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  31.68 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.97 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  38.71 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.07 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  31.21 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.38 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  32.67 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  32.75 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.52 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  28.28 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  32.92 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  32.67 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.06 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  31.29 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.5 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  23.73 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  28.31 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.24 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  29.23 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  32.67 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  29.05 
 
 		 181 aa  51.2  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  30.66 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  29.37 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  27.71 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.52 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.31 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.15 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.56 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  27.61 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  27.78 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  32.1 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  27.33 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.41 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  26.54 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  30.3 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  24.38 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  28.12 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  26.54 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  26.54 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  26.54 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.25 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  26.51 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03671  hypothetical protein  52.5 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  26.54 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.06 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  29.58 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  26.54 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.7 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  26.35 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  32.17 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  25.93 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  25.93 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.93 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.94 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  25.93 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.56 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  27.86 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>