74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1311 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  57.76 
 
 
163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  57.32 
 
 
163 aa  199  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  56.05 
 
 
178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  54.37 
 
 
167 aa  193  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  55.9 
 
 
163 aa  192  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  55.21 
 
 
173 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  54.55 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  52.76 
 
 
166 aa  179  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  50.3 
 
 
163 aa  170  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  48.75 
 
 
170 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  36.03 
 
 
168 aa  85.1  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  37.06 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.56 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.56 
 
 
173 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  34.64 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  36.02 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.03 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  35.42 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  32.89 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.09 
 
 
159 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  32.12 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  31.54 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  32.87 
 
 
155 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  32.03 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.67 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  31.82 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  32.85 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.41 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  30.08 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.48 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  38.37 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  30.46 
 
 
153 aa  62  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  27.72 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  30.59 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  27.33 
 
 
163 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.85 
 
 
165 aa  58.9  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  30.22 
 
 
152 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  26.25 
 
 
163 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.2 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  31.01 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  26.88 
 
 
163 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  30.56 
 
 
153 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  28.79 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.07 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  34.72 
 
 
155 aa  53.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  33.08 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  30.37 
 
 
181 aa  51.2  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  39.34 
 
 
86 aa  51.2  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  25.47 
 
 
164 aa  51.2  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  31.94 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.22 
 
 
168 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  33.1 
 
 
168 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.36 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  32.84 
 
 
160 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  30.66 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.43 
 
 
162 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.65 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.83 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.1 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  25.56 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  27.86 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  26.81 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  23.49 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.33 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  29.29 
 
 
172 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.71 
 
 
159 aa  41.6  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  29.41 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  29.41 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  27.51 
 
 
184 aa  41.2  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.3 
 
 
164 aa  40.8  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>