116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0028 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
182 aa  368  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  47.27 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  43.12 
 
 
190 aa  141  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  37.24 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  36.69 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  28.93 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  41.26 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  36.36 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  30.46 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  35 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  29.89 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.93 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  36.36 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.11 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.11 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.8 
 
 
164 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.43 
 
 
168 aa  61.2  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.26 
 
 
186 aa  61.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.14 
 
 
167 aa  60.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  32.86 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  35 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  30.32 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  33.55 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  31.94 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  30.54 
 
 
152 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  27.44 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  33.09 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.03 
 
 
150 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  29.33 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  28.97 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  33.33 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  28.42 
 
 
178 aa  55.8  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  30.34 
 
 
153 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  30.56 
 
 
154 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  30.77 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.22 
 
 
168 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
160 aa  54.7  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.47 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  29.45 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  30.72 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.22 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  33.33 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.93 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.78 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  29.75 
 
 
157 aa  52.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  26.76 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 
170 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  25.69 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.34 
 
 
159 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 
167 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  29.03 
 
 
185 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  28.78 
 
 
172 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  28.78 
 
 
172 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  33.33 
 
 
173 aa  51.2  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
167 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  28.47 
 
 
172 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  32.19 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  25.87 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  25.87 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  29.56 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.78 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.93 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  25.87 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  31.21 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  27.66 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.08 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  35.71 
 
 
160 aa  48.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.81 
 
 
167 aa  47.8  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  34.06 
 
 
161 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  25.17 
 
 
164 aa  47  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.02 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.62 
 
 
162 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  31.03 
 
 
165 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  31.29 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.14 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  26.76 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.64 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1112  phosphodiesterase  29.14 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.279035  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  30.72 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  28.21 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  25.75 
 
 
157 aa  45.1  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  25.75 
 
 
157 aa  45.1  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  29.75 
 
 
157 aa  45.4  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  25.13 
 
 
225 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  24.74 
 
 
173 aa  45.1  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.48 
 
 
161 aa  45.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.39 
 
 
172 aa  44.7  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.73 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.34 
 
 
169 aa  44.7  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  27.74 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  28.14 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  29.73 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  28.67 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  27.52 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  28.28 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  24 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>