104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5609 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  100 
 
 
168 aa  337  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  82.82 
 
 
182 aa  278  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  80.98 
 
 
172 aa  266  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  80.98 
 
 
172 aa  266  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  80.98 
 
 
172 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  65.66 
 
 
168 aa  221  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  63.8 
 
 
179 aa  219  9e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  65.03 
 
 
167 aa  213  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  65.45 
 
 
167 aa  213  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  64.91 
 
 
178 aa  205  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  60.71 
 
 
177 aa  203  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  61.35 
 
 
164 aa  199  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  54.27 
 
 
210 aa  171  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  42.5 
 
 
181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.68 
 
 
164 aa  114  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  42.58 
 
 
160 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.75 
 
 
160 aa  97.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.36 
 
 
165 aa  92.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  33.54 
 
 
186 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  37.76 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  35.56 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  35.56 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.89 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.87 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.52 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  33.1 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.72 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.39 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  29.41 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  30.72 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  32.03 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  31.9 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  34.72 
 
 
179 aa  72  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.15 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  28.47 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.5 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.12 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  27.82 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.01 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.36 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.87 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  31.62 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  33.78 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.31 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.74 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  23.73 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  34.31 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  33.33 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  35.15 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  34.53 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  35.44 
 
 
174 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  35.25 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  32.93 
 
 
154 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  29.17 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  26.9 
 
 
180 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.09 
 
 
150 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.19 
 
 
170 aa  55.1  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  30.41 
 
 
190 aa  54.7  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.65 
 
 
163 aa  54.7  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.45 
 
 
182 aa  54.3  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  27.38 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.48 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.13 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  28.25 
 
 
171 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  28.57 
 
 
153 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  28.07 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  27.97 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.24 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.62 
 
 
173 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  26.67 
 
 
166 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  26.9 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  29.8 
 
 
178 aa  48.5  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.62 
 
 
173 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  33.81 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  27.04 
 
 
174 aa  48.1  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  30.66 
 
 
188 aa  47.8  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  30.67 
 
 
148 aa  47.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  26.84 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.86 
 
 
186 aa  45.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  28.98 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  26.25 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.6 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
162 aa  44.7  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  31.21 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  29.17 
 
 
188 aa  44.3  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  31.68 
 
 
168 aa  44.3  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.67 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  30.2 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  33.09 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  26.04 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  22.78 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.7 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  28.29 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  29.63 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  32.67 
 
 
175 aa  42.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  31 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  25.32 
 
 
185 aa  41.6  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>