102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2834 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
179 aa  353  5.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  65.12 
 
 
182 aa  234  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  64.24 
 
 
172 aa  225  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  64.24 
 
 
172 aa  225  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  64.24 
 
 
172 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  66.88 
 
 
168 aa  223  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  65.66 
 
 
167 aa  223  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  63.8 
 
 
168 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  67.08 
 
 
167 aa  214  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  61.96 
 
 
164 aa  209  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  61.54 
 
 
177 aa  207  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  61.4 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  59.52 
 
 
210 aa  195  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  47.13 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  40.24 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.94 
 
 
164 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.01 
 
 
160 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.72 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.5 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  32.03 
 
 
161 aa  91.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  36.96 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.97 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.59 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.3 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.61 
 
 
165 aa  82  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  32.58 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  32.58 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  29.56 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  29.38 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.93 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  27.67 
 
 
155 aa  72  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  30.99 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  28.48 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.04 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.06 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  32.33 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.58 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  31.03 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  28.31 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.15 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.95 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  25.77 
 
 
168 aa  60.8  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.12 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  25.58 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.61 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  34.03 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.07 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  30.66 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  27.95 
 
 
171 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  38.21 
 
 
174 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  34.06 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  28.66 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.93 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  30.85 
 
 
190 aa  52  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  26.54 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  26.29 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  26.29 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.48 
 
 
178 aa  51.2  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  33.04 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  29.31 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.21 
 
 
162 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  32.34 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  36.62 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  32.61 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  32.61 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.67 
 
 
173 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.67 
 
 
173 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  32.09 
 
 
152 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  31.43 
 
 
175 aa  48.5  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  27.97 
 
 
180 aa  48.1  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.68 
 
 
167 aa  47.8  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  24.82 
 
 
166 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  30.58 
 
 
168 aa  47  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  29.25 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  32.65 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  25.16 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17936  predicted protein  28.17 
 
 
206 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.572241  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  27.59 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.53 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  27.46 
 
 
164 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.71 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.8 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.89 
 
 
166 aa  44.3  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  24.68 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.99 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  29.41 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  22.5 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.77 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  30.99 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.78 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  23.87 
 
 
164 aa  42  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  25.21 
 
 
158 aa  42  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  24.79 
 
 
173 aa  41.6  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  28.06 
 
 
166 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  26.75 
 
 
157 aa  41.6  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.22 
 
 
163 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  26.62 
 
 
166 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.63 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  28.29 
 
 
162 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  28.95 
 
 
176 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>