95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0138 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  332  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  47.24 
 
 
176 aa  149  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  43.9 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  44.79 
 
 
165 aa  140  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  43.98 
 
 
171 aa  135  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  39.16 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  43.37 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  42.17 
 
 
171 aa  131  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  40.96 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  37.95 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  43.11 
 
 
168 aa  127  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.83 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  37.58 
 
 
166 aa  121  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  40.49 
 
 
158 aa  115  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  40.49 
 
 
158 aa  115  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  37.04 
 
 
168 aa  115  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  36.02 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  40 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.52 
 
 
162 aa  98.2  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  34.97 
 
 
158 aa  98.2  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  36.97 
 
 
158 aa  95.1  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.55 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.73 
 
 
167 aa  90.1  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.74 
 
 
184 aa  84.7  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  34.51 
 
 
163 aa  84.3  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.32 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  33.33 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  31.37 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  28.24 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  30.26 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.71 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.65 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  29.22 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  28.47 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  28.47 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  28.47 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.22 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  27.27 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  24.22 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.03 
 
 
210 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  31.08 
 
 
177 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  27.33 
 
 
163 aa  53.9  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.51 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.62 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  27.59 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  25.56 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  27.47 
 
 
184 aa  51.6  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  26.63 
 
 
174 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.07 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.26 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.87 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  25.58 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  25.25 
 
 
225 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  30.43 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.37 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  26.67 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.26 
 
 
167 aa  48.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.82 
 
 
179 aa  47.8  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  27.08 
 
 
182 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  29.61 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.87 
 
 
222 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  29.56 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  30.11 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  27.74 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  30.11 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  30.11 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  29.55 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  30.11 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  26.83 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  26.37 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.21 
 
 
222 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.14 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  30.71 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  31.16 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.73 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  28.47 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  28.98 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  28.98 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  27.01 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  27.81 
 
 
187 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.05 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.49 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.07 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  28.98 
 
 
167 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  29.27 
 
 
181 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.95 
 
 
158 aa  42  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  26.11 
 
 
157 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  26.11 
 
 
157 aa  42  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.16 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.16 
 
 
156 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.78 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  26.28 
 
 
151 aa  40.8  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  27.55 
 
 
188 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  24.88 
 
 
636 aa  40.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>