87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1322 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
167 aa  348  3e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  58.6 
 
 
178 aa  200  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  54.37 
 
 
188 aa  193  9e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  58.13 
 
 
163 aa  191  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  55.62 
 
 
163 aa  190  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  52.17 
 
 
163 aa  180  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  54.94 
 
 
166 aa  179  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  50.62 
 
 
173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.3 
 
 
163 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  45.06 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.65 
 
 
170 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.7 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  27.27 
 
 
174 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  30.51 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  29.03 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.25 
 
 
159 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  31.58 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.16 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  32.1 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  30.72 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  30.5 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  27.81 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.37 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  34.33 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  28.39 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  30.13 
 
 
152 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  35.63 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.74 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  29.01 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  26.74 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.79 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  27.68 
 
 
177 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  27.94 
 
 
153 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  30.08 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.82 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.61 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  27.43 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  27.33 
 
 
154 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.43 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  27.1 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.58 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.07 
 
 
196 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.81 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  31.62 
 
 
172 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.84 
 
 
172 aa  54.3  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  31.62 
 
 
172 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  31.62 
 
 
172 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.94 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  26.71 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.34 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  26.54 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  30.6 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  31.47 
 
 
190 aa  52  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  26.04 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  27.88 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  27.06 
 
 
163 aa  51.2  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.7 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  23.94 
 
 
195 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.83 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  23.38 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.44 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  27.16 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  27.95 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  27.95 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  28.09 
 
 
171 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  26.35 
 
 
153 aa  48.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  27.53 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  28.09 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.78 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  23.13 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.68 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  27.74 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  27.74 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  29.34 
 
 
187 aa  45.1  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  28.83 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  26.47 
 
 
181 aa  44.3  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  29.5 
 
 
155 aa  44.3  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  26.67 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.66 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.26 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.49 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  29.11 
 
 
187 aa  42  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  27.21 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  26.35 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  36.36 
 
 
86 aa  40.8  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>