21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03671 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03671  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  53.73 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  47.76 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  47.76 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  52.63 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  48.33 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  52.73 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  60.87 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  47.37 
 
 
162 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  46.43 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  40.35 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  50 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.93 
 
 
196 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  48.98 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  52.5 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  38.71 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  47.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  42.22 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  44.44 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  43.9 
 
 
153 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  53.49 
 
 
167 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>